作為一項有可能“改變?nèi)祟惷\”的技術(shù),基因測序經(jīng)過數(shù)十年的發(fā)展,在技術(shù)研發(fā)、基礎(chǔ)研究和臨床實踐上得到了廣泛的應(yīng)用。

不久前,希望組在Github上線了三代測序數(shù)據(jù)高效糾錯、組裝軟件NextDenovo最新版本V2.0-beta.1,面向全球范圍開源并為學(xué)術(shù)研究和其它非商業(yè)用途免費開放。據(jù)悉,本次希望組發(fā)布的NextDenovo最新版除了有效解決現(xiàn)有三代測序數(shù)據(jù)運行時間長、組裝質(zhì)量不穩(wěn)定、組裝工具資源占用大的瓶頸,同時還實現(xiàn)了超大型基因組組裝和單Contig一條染色體的突破,為利用三代數(shù)據(jù)組裝基因組掃清了組裝算法的障礙。目前華為云基因容器已經(jīng)率先集成了NextDenovo最新版,既簡化了使用流程,同時也免除了應(yīng)用維護、后續(xù)資源的煩惱。

基因測序?qū)γ芗嬎愫秃Ａ繑?shù)據(jù)處理能力有較高的要求,同時也給基因測序企業(yè)帶來了存儲能力、算力等IT資源的壓力。對此,華為云早在2018年,全球首家推出了以Kubernetes為基礎(chǔ)的基因容器服務(wù)GCS,將容器技術(shù)與基因測序完美地結(jié)合在了一起。據(jù)悉,基因容器服務(wù)GCS是華為云在Kubernetes封裝了一層關(guān)于基因測序的抽象,可幫助基因行業(yè)的用戶提高資源利用率,降低環(huán)境搭建的復(fù)雜性,輕松應(yīng)對波峰波谷。華為云的基因容器解決方案具有“快、省、易、捷”的特點,可解決基因行業(yè)普遍存在的開發(fā)語言多樣、系統(tǒng)維護困難、工具碎片化等問題。

基于輕量級的容器技術(shù),GCS結(jié)合了深度學(xué)習(xí)算法、大數(shù)據(jù),為測序廠商提供了秒級可伸縮的高可靠資源、便捷一站式用戶體驗和靈活可定制的測序流程,結(jié)合希望組在基因行業(yè)內(nèi)多年來的業(yè)務(wù)積累,讓基因測序數(shù)據(jù)的計算更快、更省、更輕松,解決用戶需求。

據(jù)了解,除希望組外,國內(nèi)基因行業(yè)Top 15的企業(yè)中,14家選擇了和華為云合作。其中,上海其明信息技術(shù)有限公司在華為云容器CCI的支持下,完成了25萬例基因數(shù)據(jù)分析和挖掘,協(xié)作作出1萬多次基于基因信息的臨床決策。依托華為云CCI等技術(shù),上海其明實現(xiàn)了K8S和物理資源免運維,其實際計算成本降低了30%-50%。

不僅如此,金域醫(yī)學(xué)病理專家團隊與華為云AI團隊合作,在AI輔助病理診斷應(yīng)用開發(fā)方面取得過突破性進展,二者打造的AI輔助宮頸癌篩查模型在排陰率高于60%的基礎(chǔ)上,陽性病變的檢出率超過99.9%,同時陰性片判讀的正確率高于99%,是目前國際上已公布的AI輔助宮頸癌篩查的最高水平。

華為云與基因行業(yè)的跨界結(jié)合,將很好的解決基因行業(yè)所面臨的問題,對推動基因企業(yè)的業(yè)務(wù)帶來了積極的作用。接下來,華為云還將充分發(fā)揮自身在5G、云計算和人工智能方面的優(yōu)勢,為基因測序等科學(xué)技術(shù)領(lǐng)域作出更多的貢獻。

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